Mathematical model transcription of the operon: betIBA
Generated  states: 7
Deprecated states: 0
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variables:
1	ArcA	;	328584	328598	repressor
2	ArcA	;	328652	328666	repressor
3	BetI	;	328605	328625	repressor
parameters: 28
V_0	;	Initial rate
a_basal	;	Basal activity
k_1	;	ArcA activity
k_2	;	ArcA activity
k_3	;	BetI activity
n_11	;	 ArcA(#1)  Hill parameter
level_1	;	 ArcA(#1) rate activity parameter
n_1h1	;	 ArcA(#1)  Hill parameter
n_2h1	;	 ArcA(#1) ArcA(#2)  Hill parameter
w12	;	 cooperation parameter
level_12	;	 ArcA(#1) ArcA(#2)  activity parameter
n_1h2	;	 ArcA(#1)  Hill parameter
n_2h2	;	 ArcA(#1) ArcA(#2)  Hill parameter
n_3h1	;	 ArcA(#1) ArcA(#2) BetI(#3)  Hill parameter
w123	;	 cooperation parameter
level_123	;	 ArcA(#1) ArcA(#2) BetI(#3)  activity parameter
n_1h3	;	 ArcA(#1)  Hill parameter
n_3h2	;	 ArcA(#1) BetI(#3)  Hill parameter
w13	;	 cooperation parameter
level_13	;	 ArcA(#1) BetI(#3)  activity parameter
n_21	;	 ArcA(#2)  Hill parameter
level_2	;	 ArcA(#2) rate activity parameter
n_2h3	;	 ArcA(#2)  Hill parameter
n_3h3	;	 ArcA(#2) BetI(#3)  Hill parameter
w23	;	 cooperation parameter
level_23	;	 ArcA(#2) BetI(#3)  activity parameter
n_31	;	 BetI(#3)  Hill parameter
level_3	;	 BetI(#3) rate activity parameter

Numerator = a_basal+(level_1*((ArcA/k_1)^n_11))+(level_12*w12*((ArcA/k_1)^n_1h1)*((ArcA/k_2)^n_2h1))+(level_123*w123*((ArcA/k_1)^n_1h2)*((ArcA/k_2)^n_2h2)*((BetI/k_3)^n_3h1))+(level_13*w13*((ArcA/k_1)^n_1h3)*((BetI/k_3)^n_3h2))+(level_2*((ArcA/k_2)^n_21))+(level_23*w23*((ArcA/k_2)^n_2h3)*((BetI/k_3)^n_3h3))+(level_3*((BetI/k_3)^n_31))
Denominator = 1+((ArcA/k_1)^n_11)+(w12*(ArcA/k_1)^n_1h1*(ArcA/k_2)^n_2h1)+(w123*(ArcA/k_1)^n_1h2*(ArcA/k_2)^n_2h2*(BetI/k_3)^n_3h1)+(w13*(ArcA/k_1)^n_1h3*(BetI/k_3)^n_3h2)+((ArcA/k_2)^n_21)+(w23*(ArcA/k_2)^n_2h3*(BetI/k_3)^n_3h3)+((BetI/k_3)^n_31)
f = V_0*Numerator/Denominator
